cr.gene Ontology （基因本体论）
cr.Gene Ontology-基因产物功能数据库
cr.ontology-documentation
来源：为了查找某个研究领域的相关信息，生物学家往往要花费大量的时间，更糟糕的是，不同的生物学数据库可能会使用不同的术语，好比是一些方言一样，这让信息查找更加麻烦，尤其是使得机器查找无章可循。Gene Ontology就是为了解决这种问题而发起的一个项目。
本体是给定领域内的知识体系的形式表示。 本体通常由一组类（或术语或概念）组成，并且它们之间存在关系。 基因本体论（GO）从三个方面描述了我们对生物学领域的了解：
- 细胞功能（Molecular Function）
- 分子结构（Cellular Component）
- 生物过程（Biological Process）
In an example of GO annotation, the gene product “cytochrome c” can be described by the molecular function oxidoreductase activity, the biological process oxidative phosphorylation, and the cellular component mitochondrial matrix.
在GO注释的示例中，基因产物“细胞色素c”，根据细胞功能描述为——氧化还原酶活性，根据生物过程描述为——氧化磷酸化，根据分子结构描述为——线粒体基质。
每个GO术语都与物种无关，适用于原核生物和真核生物以及单细胞和多细胞生物的术语。
GO类由定义，标签，唯一标识符和其他几个元素组成。
GO之间的关系不是一个树状结构，首先BP，CC, MF 这3个节点是独立的，没有公共父节点的；其次，GO没有树状结构中严格的层级关系。所有也有父节点，子节点的概念，但是层级关系不明显，一个GO可以有多个父节点。
每个GO term用一个唯一的GO编号表示，前缀为GO, 后面是6位数字，如上所示，由于GO是基于已有的生物学知识构建的，而这些认知是不断修正和完善的，所有会存在有的GO term被删除了，或者是和其他GO Term合并的情况。
不同GO term之间的关系是多种多样的，比如说：
is a
part of
has part
regulation