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Datasets available about kidney and renal tumor

热度:42   发布时间:2023-11-22 23:16:49.0

Datasets available about kidney and renal tumor:

C4KC-KiTS19

可靠的肾脏和肾脏肿瘤语义分割;open on github; downloaded(脚本运行过程中有卡顿,有case的image不完整)

数据集:300例CT (10-18) in NIFTI,接受部分或彻底肾切除术的独特肾癌患者的动脉期腹部CT扫描生成了ground truth。其中210例训练,90例test。

注:数据标注是医学学生临床医师的指导下进行的,在过程掺杂了简单线性插值。fat标签的划分源于高斯模糊和阈值分割。more details in 数据说明(层厚:0.5mm)。另外由于这项challenge不要求公开code,所以在20年主办方发布了一篇关于这项challenge的整理性文章:The state of the art in kidney and kidney tumor segmentation in contrast-enhanced CT imaging: Results of the KiTS19 Challenge,站在主办方的角度分析了这项challenge的数据集,赛制,top 5的method整理,比赛的多方位的局限性及其中存在的问题以及对21届challenge的改进方向等。(讲道理,糟点挺多的,他们的文章有些真的是在演。。)

TCGA-KIRC

癌症基因组图谱肾脏肾脏透明细胞癌数据集;目的同上;open; part downloading ...

数据集:(无标注)

注:部分数据年代久远(1990年前后.)致使可参考度底下(层厚(5mm, 7.5mm)等参数或不满足研究要求(参考:KiTS19数据集的层厚介于0.5-5mm;KiTS19 top 1的literature里面提到了团队将spacing统一调整到了3.22*1.62*1.62 mm用于网络输入)),例如:

CPTAC-CCRCC

美国国家癌症研究所临床蛋白质组学肿瘤分析联合会(CPTAC)透明细胞肾细胞癌(CCRCC)数据集;open; part downloading

数据集:(无标注)

注:或存在层厚过大(5mm)等情况

TCGA-KIRP

癌症基因组图谱宫颈肾肾乳头状细胞癌数据集;open

数据集:(无标注)

注:部分层厚过大(约为7.89mm)

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