请教个问题。。

freopen("in.txt","r",stdin);         
  freopen("out.txt","w",stdout);
        while(scanf("%s%s",s1,s2)!=EOF)   
        {
                pairaln(s1,s2);
         }
  请教这个程序是从in.txt中提取两个字符串si s2,然后经过 pairaln(s1,s2);这个函数的运算，把运算结果输入到out.txt 中
可是现在我在in.txt中输入的字符串不能太多，一太多程序就不能运行，前面定义的字符串最大长度是100，我想定义超过1000，怎么解决这个问题，谢谢
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高手帮帮我啊  
现在很模糊阿
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高手们  指教啊 。。。
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用feof试试
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