http://blog.csdn.net/JavaTiger427/archive/2011/01/04/6115693.aspx
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Android?NDK?r5?windows系统上安装与使用
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一、Android?NDK?r5安装
1、cygwin的安装和简单配置
①首先到http://www.cygwin.com下载setup.exe?，接着建立安装目录，如X:\cygwin（我用的是E:\cygwin），将setup.exe放到此目录。
②启动安装：
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BEGIN->?点击setup.exe：
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③Next->选Install?from?Internet（选择在线安装方式）：
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④Next->填写Root?Directory，如X:\cygwin（选择安装路径）：
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⑤Next->填写Local?Package?Directory，如X:\cygwin\ftp（选择下载文件存放的目录）：
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⑥Next->选Direct?Connection（选择网络连接方式）：
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⑦Next->选一个较快的ftp（选择下载镜像站点）：
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⑧Next->（开始下载安装）：
⑨到了关键步骤，如果仅想安装基本系统，直接Next；如果想完全安装，点击?All旁边的旋转状图标，将Default切换至Install；如果仅想在命令行下写写程序，则只要将gcc、make等开发工具选上，还有openssh等（一般选择：autoconf2.1、automake1.10、binutils、gcc-core、gcc4-core、gdb、pcre、pcre-devel、GNU?awk）；选好后，Next->：
⑩选择需不需要创建快捷方式。->END
最后启动Cygwin,测试安装是否成功：
点击快捷方式或X:\cygwin\cygwin.bat打开控制台，如果是域用户，按照提示makepasswd和makegroup即可。
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输入命令检查
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出现以上版本信息则表明make?和gcc?已经安装成功。
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2、Android?NDK?r5?windows
①首先到官网下载Android?NDK?r5?windows
②android-ndk-r5直接解压就行了，我的路径是E:\Android_NDK
③在home\<你的用户名>\.bash_profile?文件中最后添加环境变量：打开E:\cygwin\etc\skel目录，找到.bash_profile?文件，拷贝到home\<你的用户名>\（此处为E:\cygwin\home\Administrator）下面，在最后添加环境变量
NDK=/cygdrive/<你的盘符>/
export?NDK
我的：NDK=/cygdrive/E/Android_NDK/android-ndk-r5
??????export?NDK
其中"NDK"这个名字随便起，因为后面要用经常使用，建议不要太长。
重启cygwin，输入cd?$NDK进入对应目录，就成功了。
注意：添加时用UltraEdit打开添加，如果是中文OS?使用记事本或者写字板打开编辑后，重新启动Cygwin?会报错。可以按照下图方式转换：
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二、JNI实例
1、安装成功后编译NDK中的一个例子命令行：
?? 
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编译完成后在E:\Android_NDK\android-ndk-r5\samples\hello-gl2文件夹中会生成一个文件夹libs，里面有一个子文件夹armeabi，里面生成libgl2jni.so文件。
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2、一个简单的JNI例子
下面用一个简单的例子介绍怎么生成一个.so文件以及在Android项目中怎么调用.so文件。
①首先，用Eclipse建立一个ANDROID的工程，命名为MyFirstJNI,工程代码为：
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②制作生成.so文件：可以通过获取以.h文件来获取函数申明。打开命令行，键入cd?(这个路径是使用Eclipse建立的工程目录的src的路径，我的是F:\workspace\MyFirstJNI\src)，目的是设置工程目录。然后键入：javah?-jni?com.cn.lhq.JniTest,结果如果失败，那就是因为没有把MyFirst.class文件拷贝到F:\workspace\MyFirstJNI\src\com\cn\lhq之下，原因是Eclipse的文件管理机制会将.class文件和.java文件分开到不同的目录，解决方法是将F:\workspace\MyFirstJNI\bin\com\cn\lhq的所有.class文件都拷贝到他的目录下面。再次运行javah?-jni?com.cn.lhq.JniTest即可。然后就可以看到在F:\workspace\MyFirstJNI\src下多出了一个文件：com_cn_lhq_JniTest.h，通过这个文件，我们就知道了本地接口的函数名，于是我们就根据函数名写一个com_cn_lhq_JniTest.c文件，?代码如下：
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注意：这个函数的参数与用javah生成出来的参数是不同的，这里只是需要函数名而已，因为函数名必须匹配，否则在模拟器上面跑的时候会出错，当然，如果对JNI命名规则熟悉的话可以跳过javah这步，直接写一个.c文件。
写好.c文件之后就开始生成.so文件了，这时候需要用到ANDROID.MK这个文件。于是把Eclipse生成的工程目录剪切，放到NDK目录的samples目录之下?（和示例hello-gl2一样），这个时候模仿hello-gl2文件层次结构，将MyFirstJNI文件也做成那样：在MyFirstJNI文件夹下面新建一个jni文件夹，把com_cn_lhq_JniTest.c剪切到此文件夹中，同时也拷贝一个ANDROID.MK文件到此文件夹，用UltraEdit打开ANDROID.MK文件进行修改，主要修改如下：
LOCAL_MODULE????:=?工程名
LOCAL_SRC_FILES?:=?.c的文件名（包含扩展名）
此例子应改为：
LOCAL_MODULE????:=?MyFirstJNI
LOCAL_SRC_FILES?:=?com_cn_lhq_JniTest.c
然后打开cygwin，进入E:\Android_NDK\android-ndk-r5\samples\MyFirstJNI\jni目录：
??? 
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再输入$NDK/ndk-build命令，在E:\Android_NDK\android-ndk-r5\samples\MyFirstJNI生成libs文件夹，即生成.so文件：
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③在eclipse中重新导入生成了.so文件的MyFirstJNI项目，运行效果图如下：
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http://cygwin.com/mirrors.html