首先看看三个方法的解释：
.attr()，此方法从jq1.0开始一直存在，官方文档写的作用是读/写DOM的attribute值，其实1.6之前有时候是attribute，有时候又是property。
.prop()，此方法jq1.6引入，读/写DOM的property。
.data()，此方法在jq1.2.3引入，作用是把任意的值读取/存储到DOM元素对应的jq对象上。
先说.attr()和.prop()，在jq1.6版之前，没有.prop()方法，而.attr()混淆了attribute和property的概念（不清楚他们有什么区别，请参考昨天的话题），导致使用时不小心就会出现bug，如果不读jq源码，还真说不清楚.attr()设置的是attribute还是property。
至于jq为什么这样设计，众说纷纭。有人说jq开发团队自己也没搞清楚attribute和property的区别，也有人说这是过度设计，jq认为用户没必要了解attribute和property的区别，干脆封装到一起了。不管原因是什么，jq这个设计确实不好。
2011年5月份，jq在新版本1.6版中引入新的API .prop()方法，不过升级过程挺痛苦，1.6版对比1.5.2版在.attr()的引入上没有做好向下兼容，一些人升级jq到1.6之后，发现自己的代码挂了。紧接着jq发布1.6.1版解决了兼容问题。
对于加入 .prop() 方法，jq的解释是：首先，给一些DOM对象属性property（比如nodeName，selectedIndex）的获取提供了更简洁的方案，情况前后的对比：
// 不用 .prop()
var elem = $("#foo")[0];
if ( elem ) {
index = elem.selectedIndex;
}// 用 .prop()
index = $("#foo").prop("selectedIndex");
另外还有一个原因是.prop()的效率好于.attr()。
下面说说.data()，我们知道HTML 5里面DOM标签可以加以一些data-xxx的属性，你可以把.data()看作是存取data-xxx这样DOM附加信息的方法。当然，.data()存取的内容不仅是字符串，还可以包含数组和对象。从jq1.4.3起，HTML5 的data-xxx属性会自动被添加到jq的data对象里，比如有下列代码：
<div data-role="page" data-last-value="43" data-hidden="true" data-options='{"name":"noahlu"}'></div>下面的等式都成立：
$("div").data("role") === "page";
$("div").data("lastValue") === 43;
$("div").data("hidden") === true;
$("div").data("options").name === "noahlu";尽管.data()用来存数据挺方便，它也是有过不堪回首的过去，请看：
<button id="foo" data-key="1.4000">Click me</button>
<script>
typeof $('#foo').data('key');
</script>jQuery 1.8之前的版本输出’number’，1.8版本之后输出为’string’。1.8版之前，data会把值转换成基本类型，其实我们这里想要的是’1.4000′并不是1.4。
从.data()的实际用途来看，跟.prop()似乎很像，都可以给DOM对象附加上一些自定义的值。我只能说，他们定位不同，看看他们的各自的方法名，再想想什么场景用什么方法吧。
最后，从性能上对比，.prop() > .data() > .attr()，不同浏览器不同版本.data()和.attr()的性能关系有差异，不过.prop()总是最优的。