首先感谢此贴12楼的朋友：
http://topic.csdn.net/u/20110812/10/1d456756-43c1-445e-a6f9-31a91134df13.html#r_74933552
首先我感觉这东西当单片机开发板用绝对是超值的，特别是二手的。但问题是这个太难啃了。
所以如果哪位这么干过的话，能不能分享一下经验？
感觉首先要解决的是硬件接口的问题，毕竟连到一起之后剩下的就是编程了。PCI输出的是TTL么？如果是的话貌似使用起来也挺麻烦的，有没有专用的把PCI转换成插针的卡？淘宝搜了一下，PCI转TTL的卡要好几百，如果买了绝对就又不超值了。
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只有用LPT口搞各种TTL IO的，但LPT速度不咋地。别的口怎么都要转换的，因为MCU上那堆东西老板姓根本用不上，PC厂商没必要做出来占空间。
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1）是否有相应的仿真器？
2）当把这个主板当作单板机使用时，是否需要显示装置？按键？
3）需要RAM吧，加上内存条？
4）是否需要加上程序存储的地方，为此加上硬盘吗？
5）为让板子有电，是否加上电源？
加来加去，不会又成一台台式计算机了吧？
另外台式机的CPU的构造与单片机完全不同。精力、热情和设想可以放在更值得的地方，避免走弯路。
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其实那些做仿真器什么的人都试过。就是我说的LPT口，25针打印口。以前很多自定义的设备都是从那个口上引出的，不需要驱动，只要上位机软件里读写LPT口就行了。那个能算得上最接近“当开发板用”的了。
剩下的就是某些板载显卡的VGA接口，好多ARM板带个小屏。你把电脑显示器当成PC主板这块“开发板”带的“屏”也行。要做的是把你的x86机器码放到IDE存储介质的MBR启动扇区，相当于写你自己的操作系统，只不代码从裸奔开始罢了。
至于怎么编译那些代码，可以查一查BIOS的开发过程。要把编译好的BIN或HEX写入IDE存储设备，你可能需要先把这个IDE存储设备挂到编译用的电脑上当个从盘，在Windows下面写入。
仿真调试就没法子了，至少在你搞定芯片组的LPT驱动和VGA显示之前，连个监控状态用的GPIO都没有。
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现在有那么多的单片机模拟软件，电路模拟软件，实在不想动手可以用软件来玩嘛
用PC这个平台来搞，当然，同一类的东西，不是说不行
但是，PC毕竟发展得比较远了，基本脱离了嵌入式这个行当，它自身的特点也不太适合嵌入式
打炮是可以打蚊子滴，但是，用大炮来打蚊子是要出笑话滴。
适用、够用就好。。。
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写的过程是简单，写出自己要的效果就不容易了。这种东西我只能说你想做的事情是可以实现的，至于你觉得值不值，别人觉得值得不值，谁想说服谁，那都是另一回事了。
正像你说的，改造工程花的时间是惊人的，时间本身也是成本。对我个人而言，单是花在琢磨旧主板新用法上面的时间就够再买一套i7的顶级配置了，这个经济账算起来是亏的，而且知识帐也未必划算。
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有啊，现在的工控机，很多都是和台式机类似。但工控机结构和台式机有差异，因为他们面向的对象不一样，使用环境也不一样，台式机是不能运行在工控的环境下的。实际上我们在很多复杂应用就是采用的台式机结构，只是对硬件要求更高，环境要求高。开发工具也很多啊，如果你使用在要求不高的工业环境，完全可以使用。同时口也可以很多，只要在插槽里安装你的接口卡就可以了。这些你可以参考研华的产品就调试工具，它就是台式机结构。
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不需要自己写引导
可以用DOS操作系统
DOS是单任务的,同一时间之运行一个程序
控制程序可以用c开发
输出用并口
我用这种方法做过设备改造,信号检测和输出都是没问题的.
但是后来经费没下来,控制步进电机部分没做.不知道脉冲信号输出频率能达到多少.
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但问题是现在的主板很少有并口
如果插并口扩展卡dos驱动很成问题
自己写dos驱动或裸机程序控制并口扩展卡代价都很高...
win系统又无法保证实时性,控制步进电机肯定不可能,
如果只是控制开关,那最差的单片机也能实现,据说几毛钱的都有.
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专门的工控机大把的，PC104总线的工控机也是一大把的。PC只要插上各种I/O卡，只要写程序就可以了。由于控制用的操作系统也是一大票的。如:uC/OS2、ECOS、linux、x86的windows 嵌入版....多了。你先了解一下“单片机”吧！
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楼主的想法很好，----单片机的用处一般用于控制，它的特点是“小”。PC机，它是一个比较庞大的系统，这个系统已经由最初的IBM把它“格式化”了，
----如果将PC用在控制方面，真是大才小用，当然，PC机肯定是能胜任的
我过去也想过这方面的事，并且也搞过。记得我有块拆机的LCD，很大的一块，上面驱动是T6963，十几片。费了好大功夫把它的电路画出来了，它的数据输入是8位，加上控制，一共有十几个口。
我将它与LPT口相连，刚好，数据连数据、控制接控制，然后在PC机上用C编制程序向LCD输出，后来用WINDOWS操作系统了，不能直接控制LPT，好则网上有个软件，安装后就可以直接控制了。
在过去编程器比较贵、也没有象现在的flash型单片机的时候，这种方法相当好，因为不用来回擦、来回写。少了好多麻烦-----最初单片机用紫外线擦除，可麻烦了，
但现在，一个单片机的成本相当低了，使用也相当方便了，没有必要用PC机了