如何在macOS Sierra 10.12.3上为Python 3.6安装openbabel

问题描述

我正在使用Python编写脚本来处理博士学位中的某些化学结构。 我想为python安装openbabel库。 我已尽力而为，但无法在Windows上安装它。 我早些时候发布了一个有关在Windows上安装它的问题，该问题中 但找不到解决方案。 该解决方案安装了该库，但无法运行，并且无法连接到SWIG。 不，我试图在过去5个小时的Mac办公电脑上安装它，但我不知道发生了什么。 我试图从Opnbabel的源代码安装它，并将其与python3链接，但是这引起了问题。 如果我使用以下命令：

cmake ../ -DPYTHON_BINDINGS=ON -DRUN_SWIG=ON

它成功地将其链接到我不想要的Python 2.7。 当我尝试以下选项时，它显示以下错误：

cmake ../ -DPYTHON_EXECUTABLE=/usr/bin/python3 -DPYTHON_BINDINGS=ON -DRUN_SWIG=ON

要么

cmake ../ -DRUN_SWIG=ON -DPYTHON_EXECUTABLE=/usr/bin/python3 -DPYTHON_INCLUDE_DIR=/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.5/include/python3.5m -DPYTHON_LIBRARY=/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.5/lib/libpython3.5m.dylib -DPYTHON_BINDINGS=ON

在大量成功输出后，最终会出现以下错误：

-- Found PythonInterp: /usr/bin/python3.6 (found version "1.4") 
-- Found SWIG: /usr/local/bin/swig (found version "3.0.12") 
-- Found SWIG: /usr/local/bin/swig (found suitable version "3.0.12", minimum required is "2.0") 
-- Found PythonLibs: /usr/local/Cellar/python3/3.6.0/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/libpython3.6m.dylib (found version "3.6.0") 
-- Python bindings will be compiled
CMake Error at scripts/CMakeLists.txt:120 (install):
install TARGETS given no LIBRARY DESTINATION for module target
"bindings_python".
CMake Error at scripts/CMakeLists.txt:123 (install):
install FILES given no DESTINATION!
CMake Error at scripts/CMakeLists.txt:126 (install):
install FILES given no DESTINATION!
-- Configuring incomplete, errors occurred!
See also "/usr/local/Cellar/obabel/openbabel-master/ali/CMakeFiles/CMakeOutput.log".
See also "/usr/local/Cellar/obabel/openbabel-master/ali/CMakeFiles/CMakeError.log".

我不确定为什么它将Python检测为v1.4 -- Found PythonInterp: /usr/bin/python3.6 (found version "1.4")而不是找到v.3.5。 我也尝试了python 3.6的所有过程，但是发生了相同的错误。 我还使用从github获得的openbabel，据说在下面的文章中使用这些命令： : 但它不起作用也一样 请帮助我，因为我需要此模块来进行研究。 谢谢