阿里巴巴原本并不是百度的竞争对手，它甚至曾经是所有人眼中的好人。做B2B的阿里巴巴，走在一条没人看好的路上，所以跟谁都不挨着。但是，做淘宝，让它成了易趣的对手；做支付宝，让它成了所有支付公司的对手。不过，这都是局部战争。马云一向广结善缘，在业内呼朋唤友，以东道主身份召集了数届西湖论剑，业内大腕们也都很捧场。2003年，李彦宏也曾经是马云的座上宾。但在跟杨致远、孙正义的一揽子交易之后，雅虎中国归到阿里巴巴旗下，这一下就让阿里巴巴成了几乎所有互联网公司的对手。
不过，阿里巴巴成为百度的对手，却跟雅虎中国无关。在阿里巴巴估值神奇地超过40亿美元之后，人们不得不认真地拿阿里巴巴跟百度做个比较。阿里巴巴的收入主要来自“中国供应商”、“诚信通”和“竞价排名”，缴费企业绝大部分是中小企业。百度的收入主要来自“竞价排名”，广告客户也同样主要来自中小企业。
阿里巴巴所做的事情，就是把供应商和采购商连接起来，扮演信息中介角色。在很长一段时间内，没人和阿里巴巴抢这份生意。但搜索引擎应用的日益普及和深入，交易过程开始发生改变。当越来越多的采购商习惯通过搜索引擎寻找供应商的时候，交易不再只是在一个像阿里巴巴这样的集中平台上发生，互联网成为一个巨大的交易平台。
搜索引擎更进一步的影响在于，供应商开始重视自己网站的建设，并通过网站，建立自己的客户关系和电子商务。交易只是电子商务的一个环节，但即使在这一个环节上，阿里巴巴的统一平台，也无法满足不同类型的企业的个性化需求（卖运动鞋的企业，和卖橡胶的企业，需求大相径庭）。这也是为什么像Mynet.cn这样的帮助企业建立网站、整合资源的公司，忽然有了广阔的生存空间的原因。
马云曾试图通过将雅虎完全转向搜索概念（雅虎就是搜索，搜索就是雅虎），期望以此抢占搜索份额，阻击百度对阿里巴巴客户的诱惑。不过，在豪情万丈地烧掉1.1亿元广告费后，用户反而更不知道雅虎中国是干吗的了。
好人马云一时间变成了恶人马云，B2B业务上与慧聪掐，C2C业务上和易趣、腾讯掐，在流氓软件这事儿上跟奇虎掐，在搜索业务上和百度、Google掐，IM业务上和腾讯、微软掐，据说，又要在企业软件上跟甲骨文、SAP掐了。不过，阿里巴巴有个最大的竞争优势——它不是上市公司，不需要像它的竞争对手一样，公开财务数据。多年来，马云想怎么说就怎么说，爱花多少钱就花多少钱。所以，上市这件事，大概只有一个人比较着急——杨致远。
百度是上市公司，自然不能口无遮拦。但这并非最大的问题，比较要命的是，整体上它越来越趋向于娱乐化、低龄化。Google通过Gmail、Docs、Calendar、Analytics、Base、Webmaster Central、Google Apps等生产力工具组合，让自己越来越成为一架经济引擎，而不是娱乐平台。百度的娱乐化趋势，不但可能提高广告客户的成本，还会使其品牌形象趋于低端，削弱它对商业用户的吸引力，从而降低它作为互联网商业中枢的地位。
百度说它自己的性格是：简单，可依赖。简单很容易做到，可依赖则很难。在中国企业信息化水平普遍比较低的情况下，他们对阿里巴巴仍然有着很大的依赖性。百度应该和帮助企业建站的公司合作，推动中小企业网络化的进程。不仅要当孩子王，还要当商业领袖，后一个形象可能更重要。只有这些企业充分独立了，百度才能最大化自身的价值。