NPSE
NPSE 策略计算窗口内所有可能的 k 间隔核苷酸对的出现次数。
特征表示:
fkNPSE={{AT}0,{AA}0,...,{AA}k,...,{CC}k}f^{NPSE}_k=\{\{AT\}_0,\{AA\}_0,...,\{AA\}_k,...,\{CC\}_k\} fkNPSE?={
{
AT}0?,{
AA}0?,...,{
AA}k?,...,{
CC}k?}
变量说明:
kkk:表示窗口大小
{AA}k\{AA\}_k{ AA}k?:表示k间隔核苷酸对
特征维度:16×(k+1)16\times(k+1)16×(k+1) (表示从无间隔到k间隔拼接)
**k间隔核苷酸对:**在序列“AXXXTXC”中,“AT”是一个三间隔的核苷酸对,“TC”是一个间隔的核苷酸对。