1. 安装ArcGIS Server for Java，导入ISO文件到虚拟光驱，点击setup.exe文件，进入安装页面。选择ArcGIS Server for Java。 ArcGIS Server需要占用8099、8399端口，8099是服务管理服务的端口，8399是rest服务的端口，软件会自动安装配置的Tomcat。
2. 安装过程中除了需要改变安装路径之外，一律Next，软件会自动安装SOA、SOM服务，并且安装地图管理服务。
3. 注册：在安装完了软件后，将弹出一个配置服务的对话框（GIS Server Post Install），在Welcome to the GIS Server Post Install页面中，两个复选框都选中，点下一步。在Specify GIS Server Accounts页面中，配置ArcGISSOM和ArcGISSOC的密码。在GIS Server Webservices Account页面中，为ArcGISWebServices配置密码（这些用户名和密码，一定要记住了，以后登录Server的管理模块和链接服务都需要用到）。在Specify GIS Server directories中，为Web Server 制定路径、站点名称和站点端口。后边一路next。在Registration Options中选择第三个（I have received an authorization file from ESRI and am now ready to finish the registration process）。在Software Authorization中，选择你的license文件，点Browse，选择安装文件夹下的ecp文件完成注册。
4. 更改组和用户属性：右键我的电脑，选择管理菜单，进入计算机管理页面。选择本地用户和组，此处对用户和组任意一项配置即可，另一项将自动做相应的配置。此处仅介绍组配置。
Administrators组，其成员为：Administrator、ArcGISSOM和ArcGISWebServices；
agsadmin组，其成员为：Administrator、ArcGISSOM和ArcGISWebServices；
agsusers组，其成员为：Administrator、ArcGISSOM和ArcGISSOC。
Users组，其成员为：ArcGISSOM、ArcGISSOC和ArcGISmanager。
注意，此处仅说明了是与GIS有关的组的成员信息，若该组在其他方面还有成员，其他成员不要乱删。
5. 打开ArcGIS-> ArcGIS Server for the Java Platform->ArcGIS Server Manager,User name中输入用户名"登录名（Administrator"ArcGISWebServices），密码就是你配置ArcGISmanager时的密码，若你用其他用户名登录，密码为相应密码。登录成功后，则可以发布相应的ArcGIS Server服务。
6. 注意事项：如果无法登陆，首先看是否开启了防火墙，如果是杀毒软件的防火墙，关闭就可以了！如果是Windows自带的防火墙，则可以通过添加意外处理，具体方法如下：控制面板―>防火墙，先添加web端口：8399、8099；ArcSOM端口：135；添加ArcSOM.exe、 ArcSOC.exe两个应用程序， 均存放在ArcGIS\bin\目录下面！
7. arcgis server 9.3（Java）安装要求：占用磁盘空间大约1.5G左右，需要有Jdk开发环境！
8. ArcGIS Server Java 9.3 REST API的中文查询问题的解决方案：目前在ArcGIS Server 9.3 Java中使用中文进行REST查询时是有问题的，这是ArcGIS Server for Java集成的tomcat的问题，解决方案一：
a、ArcGIS Server Java9.3可以把services和rest单独导出成war包，部署到其他的web服务器上，从而可以避免内置tomcat的性能瓶颈。进入 Manager-->services-->Configure ServicesHandler-->Export页面，把rest服务导出成rest.war，保存到本地；
b、把保存下来的rest.拷贝到任何一个其他版本的tomcat 的webapps目录下（ArcGIS Server内置的tomcat是5.5.9版本，我测试用的是apache-tomcat-6.0.20），此时的Tomcat应该配置服务器端的编码为UTF-8。
c、启动tomcat6.0.20，在浏览器中输入http://localhost:8080/rest，进入service directory页面。
d、选中服务的图层进行查询，输入中文进行查询，看是否可以得到正确的结果。
有人反映这个方案不能解决问题，可能和tomcat的版本有关，还有另外两种解决方案：
方案1：
从客户端入手。
中文不能查询的根本原因在于编码，当我们在使用RESTAPI进行查询的时候，请求的URL一般是这样：
“http://wuyfsles:8399/arcgis/rest/services/BeijingTraffic/MapServer /find?searchText=事故&contains=true&searchFields=&sr=& layers=0&returnGeometry=true”，其中的中文无法被服务器识别。因此，你可以在发送前对“事故”这个中文关键词进行 URL编码，应该是“%CA%C2%B9%CA”，你在浏览器中输入
“http://wuyfsles:8399/arcgis/rest/services/BeijingTraffic/MapServer /find?searchText=%CA%C2%B9%CA&contains=true&searchFields=& sr=&layers=0&returnGeometry=true”的时候，是不是可以看到结果了？
方案2：
从服务器端入手，还是着手解决编码问题。
既然tomcat有问题，我们就在tomcat身上开刀。以Linux为例，分别打开“/arcgis/java/manager/service/tomcat/managerappserver/conf/server.xml”和
“/arcgis/java/manager/service/tomcat/managerserver/conf/server.xml”，找到“Connector”元素，如图添加属性URIEncoding="UTF-8"。保存退出，重启tomcat和ArcGIS Server。
http://pygisblog.appspot.com